Vi presenterar ett filtreringsbaserat protokoll för att isolera högkvalitativa kärnor från tvärbunden muskelskelettmuskel, där vi avlägsnade behovet av ultracentrifugering, vilket gör det lätt att använda. Vi visar att kromatin framställt från kärnorna är lämplig för kromatinimmunutfällning och sannolikt kromatinimmunutfällnings-sekvenseringsstudier.