التحقيق المتعددة، التعديلات بوستترانسلاشونال الذاتية لبروتين هدف يمكن أن تكون صعبة للغاية. الأساليب الموصوفة هنا الاستفادة من نظام المخزن المؤقت وتصفية تحلل أمثل وضعها مع محددة تستهدف PTM، تقارب مصفوفات للكشف عن أسيتيليشن، أوبيكويتينيشن، سومويليشن 2/3، والتيروزين الفسفرة التعديلات لهدف البروتين باستخدام نظام وحيد ومبسطة.