Journal
/
Genetics
/
Aanpassing van hybridisatie inname van chromatine-geassocieerde eiwitten voor Proteomics op zoogdiercellen
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Adaptation of Hybridization Capture of Chromatin-associated Proteins for Proteomics to Mammalian Cells
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Aanpassing van hybridisatie inname van chromatine-geassocieerde eiwitten voor Proteomics op zoogdiercellen

DOI:
10.3791/57140-v

•

09:27 min

•

June 01, 2018

•

, , , , , , ,
1Department of Genetics,Texas Biomedical Research Institute, 2Department of Internal Medicine-Molecular Medicine,Wake Forest University School of Medicine, 3Department of Chemistry,University of Wisconsin

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:44Cell Culture
  • 03:13Lysis and Shearing
  • 04:14Hybridization Capture
  • 06:14Evaluation of Capture Yield by qPCR with Primers for the Target Capture Region of Interest
  • 07:12Results: Hybridization Capture of Chromatin-associated Proteins in Mammalian Cells
  • 08:38Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Dit is een methode om nieuwe DNA-interactie eiwitten op specifieke doelgroep loci, afhankelijk van de volgorde-specifieke inname van kruisverwijzende chromatine voor latere proteomic analyses identificeren. Geen voorkennis vereist over potentiële bindende proteïnen, noch cel wijzigingen zijn vereist. In eerste instantie ontwikkeld voor gist, is de technologie inmiddels aangepast voor zoogdiercellen.

Tags

Hybridization CaptureChromatin-associated ProteinsProteomicsMammalian CellsGenome RegulationDNA Binding ProteinsCell CultureCross-linkingFormaldehydeGlycine

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

-Methyl-bindende DNA capture Sequencing for Patient Tissues

Analyse van Cap-bindende eiwitten in menselijke cellen blootgesteld aan Physiological Oxygen Voorwaarden

Selectieafhankelijke en onafhankelijke generatie van CRISPR / Cas9-gemedieerde Gene Knockouts in zoogdiercellen

Generatie van genoom-brede chromatine conformatie Capture bibliotheken uit strak geënsceneerde vroege Drosophila embryo 's

Formaldehyde-bijgewoonde isolatie van regelgevende elementen maatregel chromatine toegankelijkheid in zoogdiercellen

Een eenvoudige, snelle en kwantitatieve bepaling aan maatregel reparatie van DNA-proteïne Crosslinks op plasmiden Transfected in zoogdiercellen

Een snelle en kwantitatieve methode voor de posttranslationele wijziging en Variant ingeschakeld toewijzing van peptiden aan Genomes

CRISPR gids RNA klonen voor zoogdieren systemen

Chromatische immunoprecipitatie test met behulp van Micrococcal nucleasen in zoogdiercellen

Massa spectrometrie gebaseerde Proteomics Analyses met behulp van de OpenProt Database te onthullen nieuwe eiwitten vertaald uit niet-canonieke Open lezing Frames

Read Article