Journal
/
Genetics
/
Tilpasning av hybridisering erobringen av Chromatin-assosiert proteiner for Proteomikk til pattedyrceller
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Adaptation of Hybridization Capture of Chromatin-associated Proteins for Proteomics to Mammalian Cells

Tilpasning av hybridisering erobringen av Chromatin-assosiert proteiner for Proteomikk til pattedyrceller

DOI:
10.3791/57140-v

•

09:27 min

•

June 01, 2018

•

, , , , , , ,
1Department of Genetics,Texas Biomedical Research Institute, 2Department of Internal Medicine-Molecular Medicine,Wake Forest University School of Medicine, 3Department of Chemistry,University of Wisconsin

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:44Cell Culture
  • 03:13Lysis and Shearing
  • 04:14Hybridization Capture
  • 06:14Evaluation of Capture Yield by qPCR with Primers for the Target Capture Region of Interest
  • 07:12Results: Hybridization Capture of Chromatin-associated Proteins in Mammalian Cells
  • 08:38Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Dette er en metode for å identifisere romanen DNA-samspill proteiner på bestemt mål loci, stole på sekvens-spesifikke erobringen av krysskoblet chromatin for påfølgende proteomic analyser. Det kreves ingen forhåndskunnskaper om potensielle bindende proteiner, eller cellen modifikasjoner. Opprinnelig utviklet for gjær, har teknologien nå blitt tilpasset for pattedyrceller.

Tags

Hybridization CaptureChromatin-associated ProteinsProteomicsMammalian CellsGenome RegulationDNA Binding ProteinsCell CultureCross-linkingFormaldehydeGlycine

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Metyl-binding DNA-fangst Sekvense for Pasientservietter

Analyse av Cap-bindende proteiner i humane celler eksponert for Fysiologiske oksygenforholdene

Utvalgsavhengig og uavhengig generasjon av CRISPR / Cas9-medierte Gene Knockouts i mammale celler

Generasjon av genomet hele Chromatin konformasjon fange biblioteker fra tett trinnvis tidlig Drosophila embryo

Formaldehyd-assistert isolering av regulatoriske elementer for å måle Chromatin tilgjengelighet i pattedyrceller

En enkel, rask og kvantitative analysen mål reparasjon av DNA-protein krysskoblinger på plasmider transfekterte i pattedyrceller

En rask og kvantitativ metode for post-translasjonell modifikasjon og Variant aktivert tilordning av peptider å genomer

CRISPR Guide RNA kloning for pattedyr systemer

Kromatin Immunutfelling analysen bruke Micrococcal Nukleaser i pattedyrceller

Masse massespektrometri-baserte Proteomikk analyser bruker OpenProt databasen å avsløre romanen proteiner oversatt fra ikke-kanoniske åpent lesing rammer

Read Article