Journal
/
Genetics
/
At udforske Root Microbiome: udtrække bakteriel Fællesskabets Data fra jord, rhizosfære og rod Endosphere
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Exploring the Root Microbiome: Extracting Bacterial Community Data from the Soil, Rhizosphere, and Root Endosphere

At udforske Root Microbiome: udtrække bakteriel Fællesskabets Data fra jord, rhizosfære og rod Endosphere

DOI:
10.3791/57561-v

•

09:55 min

•

May 02, 2018

•

, , ,
1Department of Plant and Microbial Biology,University of California, Berkeley, 2Plant Gene Expression Center,USDA ARS

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:46Collection and Separation of Root Endosphere, Rhizosphere, and Soil Samples
  • 02:47DNA Extraction
  • 04:11Amplicon Library Preparation and Submission
  • 08:21Results: Effective DNA Amplification
  • 09:10Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Her, beskriver vi en protokol for at opnå amplikon sekvens data af jord, rhizosfære og roden endosphere microbiomes. Denne information kan bruges til at undersøge sammensætningen og mangfoldighed af plante-forbundet mikrobielle samfund, og er velegnet til brug med en bred vifte af plantearter.

Tags

Root MicrobiomeSoilRhizosphereRoot Endosphere16S Ribosomal RNA GeneCommunity ProfilingMicrobial EcologyDNA ExtractionSequencing LibrarySoil CoreRhizosphere SeparationRoot WashingDNA Extraction

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Konjugering Parring Analyser for Sekvens-specifik analyse af Transfer proteiner involveret i konjugation

Transkriptom Analyse af<em> C</em>.<em> elegans</em> RNA sekventering data via Tuxedo Suite på Galaxy-projektet

Tovejs Retroviral Integration Site PCR Metode og Quantitative Data Analysis Workflow

Bestemmelse af Optimal kromosomale placering for en DNA Element i Escherichia coli ved hjælp af en roman Transposon-medieret tilgang

Forberedelse af prøver og analyser af RNASeq-baseret genekspression Data fra zebrafisk

IT analyse af sekvens Data fra Batch gær 2-Hybrid skærme

At udforske effekter rumflyvninger på musen fysiologi ved hjælp af den åbne adgang NASA GeneLab Platform

Isolering, sekventering og analysere ekstracellulære MicroRNA fra humane mesenkymale stamceller

Ved hjælp af in Vitro og i celler form at undersøge lille molekyle induceret Pre-mRNA strukturelle ændringer

Tomatrod Transformation Efterfulgt af podning med Ralstonia Solanacearum for ligetil genetisk analyse af bakteriel visnesygdom

Read Article