Journal
/
Bioengineering
/
En ultrahög kapacitet mikroflödessystem plattform för Single-cell Genomsekvensering
JoVE Journal
Bioengineering
This content is Free Access.
JoVE Journal Bioengineering
An Ultrahigh-throughput Microfluidic Platform for Single-cell Genome Sequencing
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

En ultrahög kapacitet mikroflödessystem plattform för Single-cell Genomsekvensering

DOI:
10.3791/57598-v

•

10:00 min

•

May 23, 2018

•

, , ,
1Department of Bioengineering and Therapeutic Sciences, California Institute for Quantitative Biosciences,University of California, San Francisco, 2UC Berkeley-UCSF Graduate Program in Bioengineering,University of California, San Francisco, 3Chan Zuckerberg Biohub

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:48Encapsulation of Cells in Agarose Microgels
  • 02:48Breaking the Agarose Microgels
  • 03:54Generating Barcode Droplets by Digital PCR
  • 04:53Tagmentation of Genomic DNA in Droplets
  • 05:48Single-cell Barcoding by Microfluidic Double Merger
  • 08:25Results: Ultrahigh Throughput Sequencing of Single-cell Genomes
  • 09:24Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Encelliga sekvensering avslöjar genotypisk heterogenitet i biologiska system, men nuvarande teknik saknar genomströmning nödvändigt för djupa profilering av gemenskapens sammansättning och funktion. Här, vi beskriver en mikroflödessystem arbetsflöde för sekvensering > 50.000 encelliga genomen från olika cell populationer.

Tags

Single-cellGenome SequencingMicrofluidicsHigh-throughputBarcodingCell LysisAgaroseDroplet GenerationCell EncapsulationGenomic HeterogeneityCell SuspensionPBSSurfactantSyringe PumpTemperature ControlCollectionOil RemovalPFO

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Hög genomströmning Protein Expression Generator Med en mikroflödessystem plattform

Microfluidic pikoliter Bioreaktor för Microbial Encelliga Analys: Fabrication, Systeminställningar, och Operation

Cell Klämma som en robust, mikroflödes Intracellular Delivery Platform

Mikroflödes Plattform för Mätning Neutrophil Chemotaxis från Cement helblod

Multi-orgeln Chip - En mikroflödes Plattform för Långsiktig Flervävnads Coculture

En mikroflödessystem plattform för hög genomströmning Single-cell isolering och kultur

Mikroflödes Plattform med Multiplex elektronisk detektering för rumslig Spårning av partiklar

Imaging rotahåret morfologi av Arabidopsis plantor i en två-lagers mikroflödessystem plattform

En mikroflödessystem plattform för längsgående Imaging i Caenorhabditis elegans

Ultra lång Läs sekvensering för hela genomiskt DNA analys

Read Article