Journal
/
Bioengineering
/
Microfluidic платформа сверхвысокой пропускной способности для одной ячейки генома
JoVE Journal
Bioengineering
This content is Free Access.
JoVE Journal Bioengineering
An Ultrahigh-throughput Microfluidic Platform for Single-cell Genome Sequencing
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Microfluidic платформа сверхвысокой пропускной способности для одной ячейки генома

DOI:
10.3791/57598-v

•

10:00 min

•

May 23, 2018

•

, , ,
1Department of Bioengineering and Therapeutic Sciences, California Institute for Quantitative Biosciences,University of California, San Francisco, 2UC Berkeley-UCSF Graduate Program in Bioengineering,University of California, San Francisco, 3Chan Zuckerberg Biohub

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:48Encapsulation of Cells in Agarose Microgels
  • 02:48Breaking the Agarose Microgels
  • 03:54Generating Barcode Droplets by Digital PCR
  • 04:53Tagmentation of Genomic DNA in Droplets
  • 05:48Single-cell Barcoding by Microfluidic Double Merger
  • 08:25Results: Ultrahigh Throughput Sequencing of Single-cell Genomes
  • 09:24Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Секвенирование одной ячейки показывает генотипическая гетерогенность в биологических системах, но современные технологии не хватает пропускной способности, необходимые для глубокого профилирования сообщества состав и функции. Здесь мы описываем microfluidic рабочего процесса для секвенирования > 50,000 одноклеточных геномов из различных мобильных популяций.

Tags

Single-cellGenome SequencingMicrofluidicsHigh-throughputBarcodingCell LysisAgaroseDroplet GenerationCell EncapsulationGenomic HeterogeneityCell SuspensionPBSSurfactantSyringe PumpTemperature ControlCollectionOil RemovalPFO

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Высокая пропускная способность экспрессии белков генератора с использованием платформы Микрофлюидных

Microfluidic Picoliter Bioreactor for Microbial Single-cell Analysis: Fabrication, System Setup, and Operation

Сотовый Сжатие как Robust, микрофлюидных внутриклеточного Delivery Platform

Микрофлюидных Платформа для измерения хемотаксис нейтрофилов из необработанного цельной крови

Multi-орган Chip - Микрожидкостных Платформа для долгосрочных Multi-ткани сокультивирования

Микрожидком Платформа с высокой пропускной способностью изоляции одноклеточные и культуры

Микрожидкостных Платформа с уплотненными электронным детектором для пространственного слежения частиц

Изображения корневого волоска морфология Arabidopsis саженцев в два слоя Microfluidic платформа

Microfluidic платформа для продольной Imaging в Caenorhabditis elegans

Долговечный чтения последовательности для анализа всей геномной ДНК

Read Article