A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Chapters
- 00:04Title
- 00:44Tick Surface Sterilization, DNA Purification, and 16S rRNA Gene Amplification
- 02:3016S Amplicon Purification
- 03:59Sample Barcoding and Purification
- 04:58Library Quantification and Normalization
- 06:01Results: Community Ecology of the Ixodes Microbiome
- 06:43Conclusion
Her presenterer vi en neste generasjons sekvensering protokoll for 16S rRNA sekvensering som gjør identifisering og karakterisering av mikrobielle samfunn i vektorer. Denne metoden innebærer DNA utvinning, forsterkning og barcoding av prøver gjennom PCR, sekvensering flyt-celle og bioinformatikk å matche sekvens data til phylogenetic informasjon.
