En protokoll for utviklingen av anlegget thylakoid protein kompleks organisasjonen og komposisjon med blå innfødt polyakrylamid gel geleelektroforese (BN-side) og 2D-SDS-side er beskrevet. Protokollen er optimalisert for Arabidopsis thaliana,, men kan brukes for andre plantearter med mindre modifikasjoner.