Her rapporterer vi vanlige metoder for å analysere phagocytic funksjon murine alveolar makrofager og bakteriell klaring fra lungene. Disse metodene studere i vitro fagocytose av fluorescein isothiocyanate perler og i vivo fagocytose Pseudomonas aeruginosa Green fluorescerende protein. Vi har også beskriver en metode for å fjerne P. aeruginosa i mus.