Her presenterer vi en detaljert protokoll for å oppdage og kvantifisere proteinnivåer under kraniofacial morphogenesis/patogenesen av immunostaining ved hjelp av musen kraniofacial vev som eksempler. I tillegg beskriver vi en metode for utarbeidelse og kryosnitt av undecalcified harde vev fra unge mus for immunostaining.