Journal
/
Genetics
/
Förbättrad jäst en-hybrid skärmar att identifiera transkriptionsfaktor som binder till humant DNA sekvenser
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Enhanced Yeast One-hybrid Screens To Identify Transcription Factor Binding To Human DNA Sequences
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Förbättrad jäst en-hybrid skärmar att identifiera transkriptionsfaktor som binder till humant DNA sekvenser

DOI:
10.3791/59192-v

•

11:25 min

•

February 11, 2019

•

, , ,
1Department of Biology,Boston University, 2Bioinformatics Program,Boston University

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:49Spotting a Transcription Factor (TF) Array
  • 04:19Enhanced Yeast One-hybrid (eY1H) Screen
  • 08:48Results: Examples of eY1H Readout Plates and Potential Problems
  • 10:28Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Här presenterar vi en förbättrad jäst en-hybrid screening protokoll för att identifiera de transkriptionsfaktorer (TFs) som kan binda till en mänsklig DNA-region av intresse. Denna metod använder en hög genomströmning screening pipeline som kan förhöra bindningen av > 1 000 TFs i ett enda experiment.

Tags

Transcription FactorYeast One-hybridDNA SequenceFunctional GenomicsGene PromotersEnhancersNon-coding VariantsArray RobotHigh Density96-well Plates384-well Plates1536-well PlatesColony ArraySc Minus Tryptophan

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Metyl-bindande DNA fånga sekvensering för patientvävnader

Analys av Cap-bindande proteiner i mänskliga celler som utsätts för fysiologiska syreförhållanden

QTL-kartläggning och CRISPR / Cas9 redigering för att identifiera en läkemedelsresistensgen i<em> Toxoplasma gondii</em

Laser Microirradiation att studera In Vivo cellulära svar till enkla och komplexa DNA-skador

Realtidsanalys av transkriptionsfaktor som bindande, transkription, översättning och omsättning under cellulär aktivering med visning av globala händelser

RNA Pull-down förfarande att identifiera RNA mål av en lång icke-kodande RNA

Gen-riktade slumpmässig mutagenes att välja Heterokromatin-destabiliserande proteasom mutanter i Fission jäst

Datoriserad analys av sekvensdata från Batch jäst 2-Hybrid skärmar

Avgörande 3'-Termini och sekvenser av begynnande enkelsträngat virala DNA-molekyler under HIV-1 omvänd Transkription i infekterade celler

Utforska Sekvensutrymme för att identifiera bindnings platser för regulatoriska RNA-bindande proteiner

Read Article