Journal
/
Genetics
/
Digitalt PCR-baseret konkurrencemæssigt indeks til analyse af egnethed til salmonella med høj gennemløb
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Digital PCR-based Competitive Index for High-throughput Analysis of Fitness in Salmonella

Digitalt PCR-baseret konkurrencemæssigt indeks til analyse af egnethed til salmonella med høj gennemløb

DOI:
10.3791/59630-v

•

07:11 min

•

May 13, 2019

•

,
1Department of Medical Microbiology and Immunology,Creighton University School of Medicine

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:43Validate the Sensitivity and Specificity of Each Primer-probe Set for Each Genomic Barcode Using Digital PCR
  • 03:09Analyze Digital PCR Data and Calculate Absolute Copy Numbers
  • 04:52Results: Representative Digital PCR Results of Diluted AA-barcoded gDNA
  • 06:28Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Denne molekylære tilgang til bestemmelse af bakterie egnethed letter præcis og præcis påvisning af mikroorganismer ved hjælp af unikke genomiske DNA-stregkoder, der kvantificeres via Digital PCR. Protokollen beskriver beregningen af konkurrence indekset for salmonella stammer teknologien er dog let at tilpasse til protokoller, der kræver absolut kvantificering af enhver genetisk-formbare organisme.

Tags

Digital PCRCompetitive IndexHigh-throughput AnalysisFitnessSalmonellaQuantificationMixed PopulationMolecular-based TechniquesGenetic MarkersBacterial ChromosomesGenomic DNADilution SeriesDigital PCR SupermixProbe-based ChemistryNo Template ControlsNegative ControlsPositive ControlsDroplet GeneratorThermal CyclerData Analysis Software

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

En robot platform for High-throughput protoplastisolering og Transformation

High-Throughput robotersvejsede Assisted Isolering af temperaturfølsomme Lethal mutanter i<em> Chlamydomonas reinhardtii</em

Høj fedt diæt fodring og High Throughput Triacylglyceride Assay i Drosophila Melanogaster

Generation af indfødte kromatin Immunoprecipitation sekventering biblioteker for Nucleosome tæthed analyse

G2-seq: En High Throughput sekventering-baseret teknik til identifikation af sent replikerende regioner i genomet

Robust DNA isoleret og høj overførselshastighed sekventering bibliotek konstruktion til Herbarium prøver

Høj overførselshastighed identifikation af synergistiske Drug kombinationer af overlapning2 metode

Høj overførselshastighed DNA-ekstraktion og genotypebestemmelse af 3dpf zebrafisk larver af Fin klipning

Høj overførselshastighed identifikation af regulerende gensekvenser ved hjælp af næste generations sekventering af cirkulære kromosom kropsbygning Capture (4C-seq)

High-gennemløb DNA plasmid multiplexing og Transfection ved hjælp af akustisk Nanodispenserings teknologi

Read Article