A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Chapters
- 00:04Title
- 00:43Validate the Sensitivity and Specificity of Each Primer-probe Set for Each Genomic Barcode Using Digital PCR
- 03:09Analyze Digital PCR Data and Calculate Absolute Copy Numbers
- 04:52Results: Representative Digital PCR Results of Diluted AA-barcoded gDNA
- 06:28Conclusion
Esta aproximação molecular-baseada para determinar a aptidão bacteriana facilita a deteção exata e exata dos micro-organismos usando os códigos de barras genomic originais do ADN que são quantificados através do PCR digital. O protocolo descreve o cálculo do índice competitivo para cepas de Salmonella ; Entretanto, a tecnologia é prontamente adaptável aos protocolos que exigem a quantificação absoluta de todo o organismo genetically-maleável.
Tags
Digital PCRCompetitive IndexHigh-throughput AnalysisFitnessSalmonellaQuantificationMixed PopulationMolecular-based TechniquesGenetic MarkersBacterial ChromosomesGenomic DNADilution SeriesDigital PCR SupermixProbe-based ChemistryNo Template ControlsNegative ControlsPositive ControlsDroplet GeneratorThermal CyclerData Analysis Software
