Dette molekylær-baserte tilnærmingen for å bestemme bakteriell fitness muliggjør presis og nøyaktig påvisning av mikroorganismer ved hjelp av unike genomisk DNA strekkoder som er kvantifisert via Digital PCR. Protokollen beskriver beregning av konkurransedyktige indeksen for Salmonella stammer; teknologien er imidlertid lett å tilpasse til protokoller som krever absolutt kvantifisering av genetisk formbare organisme.