Drosophila fly muskelen er en kraftfull modell for å studere transcriptional regulering, alternative skjøting, metabolisme, og mechanobiology. Vi presenterer en protokoll for Disseksjon av fluorescerende-merket fly muskelen fra live pupae å generere svært beriket prøver ideell for Proteomikk og dyp-sekvensering. Disse prøvene kan tilby viktig mekanistisk innsikt i ulike aspekter av muskelutvikling.