Journal
/
Genetics
/
Проверка секвенирования всего генома нанопор, использование вируса Усуту в качестве примера
JoVE Journal
Genetics
This content is Free Access.
JoVE Journal Genetics
Validating Whole Genome Nanopore Sequencing, using Usutu Virus as an Example
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Проверка секвенирования всего генома нанопор, использование вируса Усуту в качестве примера

DOI:
10.3791/60906-v

•

05:45 min

•

March 11, 2020

•

, , ,
1ErasmusMC, Department of Viroscience, WHO Collaborating Centre for Arbovirus and Viral Hemorrhagic Fever Reference and Research,Erasmus University Medical Center

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:59Nanopore Data Consensus Sequence Generation
  • 02:33Nanopore Sequencing Error Profile Compensation
  • 03:54Results: Representative Nanopore Sequencing Error Rate Overview
  • 04:58Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Ранее мы утвердили протокол для ампрона на основе всего генома usutu вируса (USUV) секвенирования на нанопор секвенирования платформы. Здесь мы описываем методы, используемые более подробно, и определяем частоту ошибок ячейки потока nanopore R10.

Tags

Artificial IntelligenceAI Writing AssistantsCopywritingContent GenerationText-based ContentContent CreationAI-assisted WritingWriter’s BlockContent EfficiencyReal-time SequencingVirus Genetic SequencingNanopore SequencingUsutu VirusError RateRead CoverageSequence DataConsensus SequenceReference-based AlignmentMinimap2SamtoolsKMA

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Сопоставление взаимодействия РНК-РНК в глобальном масштабе с использованием биотинилированного псоралена

Поколения родной Chromatin иммунопреципитации секвенирования библиотек для анализа плотности нуклеосома

G2-seq: Высокая пропускная способность на основе последовательности техника для выявления поздно репликации областей генома

Профилирования времени репликации ДНК, используя данио рерио как в естественных условиях модель системы

Обнаружение редких событий, с помощью Исправлена ошибка ДНК и РНК последовательности

Сверхнизкое ввода геном последовательность подготовки библиотеки от Tardigrade единичная

Усиление возле полнометражного ВИЧ-1 Proviruses для виртуализации нового поколения

Отделяя бактерии капсула величину, с использованием градиента разрывными плотность

Геном редактирование в Mammalian клеток линии, используя ТРИФОСФАТЫ-Cas

Секвенирование мРНК из цельной крови с использованием секвенирования Наноруды

Read Article