Journal
/
Genetics
/
Tüm Genom Nanopore Sıralama doğrulama, Örnek olarak Usutu Virüs kullanarak
JoVE Journal
Genetics
This content is Free Access.
JoVE Journal Genetics
Validating Whole Genome Nanopore Sequencing, using Usutu Virus as an Example
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Tüm Genom Nanopore Sıralama doğrulama, Örnek olarak Usutu Virüs kullanarak

DOI:
10.3791/60906-v

•

05:45 min

•

March 11, 2020

•

, , ,
1ErasmusMC, Department of Viroscience, WHO Collaborating Centre for Arbovirus and Viral Hemorrhagic Fever Reference and Research,Erasmus University Medical Center

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:59Nanopore Data Consensus Sequence Generation
  • 02:33Nanopore Sequencing Error Profile Compensation
  • 03:54Results: Representative Nanopore Sequencing Error Rate Overview
  • 04:58Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Daha önce bir nanopore sıralama platformu üzerinde amplicon tabanlı tüm genom Usutu virüsü (USUV) sıralama için bir protokol doğruladı. Burada, daha ayrıntılı olarak kullanılan yöntemleri açıklar ve nanopore R10 akış hücresinin hata oranını belirleriz.

Tags

Artificial IntelligenceAI Writing AssistantsCopywritingContent GenerationText-based ContentContent CreationAI-assisted WritingWriter’s BlockContent EfficiencyReal-time SequencingVirus Genetic SequencingNanopore SequencingUsutu VirusError RateRead CoverageSequence DataConsensus SequenceReference-based AlignmentMinimap2SamtoolsKMA

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

RNA-RNA Etkileşmelerini Biyotinlenmiş Psooren Kullanarak Küresel Olarak Haritalama

Nucleosome yoğunluk analiz için kitaplıklarına sıralama yerli Kromatin Immunoprecipitation nesil

G2-seq: geç genom bölgelerinde çoğaltma tanımlamak için bir yüksek işlem hacmi-dayandırılmış tekniği

Zebra balığı bir Vivo içinde Model sistemi olarak kullanarak DNA çoğaltma zamanlaması profil oluşturma

Nadiren de olsa algılama hatası düzeltildi DNA ve RNA sıralama

Ultralow giriş genom Kütüphane hazırlık bir tek Tardigrade örnekten sıralama

Amplifikasyon tam uzunlukta HIV-1 Proviruses yakınındaki yeni nesil sıralama için

Kapsül tutarı kesintili yoğunluk Gradient kullanarak bakterilerin ayıran

Memeli hücre CRISPR-Cas kullanarak satırları genom düzenleme

Nanopore sıralamayı kullanarak tüm kan mRNA sıralaması

Read Article