Описан весьма параллельный метод измерения специфического участка расщепления ДНК на уровне одной молекулы. Этот протокол демонстрирует технику с использованием ограничения endonuclease NdeI. Метод может быть легко изменен для изучения любого процесса, что приводит к сайту конкретных расщепления ДНК.