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Interrogación pareada específica de células del epigenoma ovárico y transcriptoma de ratón

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Cell-Specific Paired Interrogation of the Mouse Ovarian Epigenome and Transcriptome

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Interrogación pareada específica de células del epigenoma ovárico y transcriptoma de ratón

DOI:

10.3791/64765-v

•

12:25 min

•

February 24, 2023

•

Sarah R. Ocañas*^1,2,3, José V. V. Isola*^1,3, Tatiana D. Saccon, Kevin D. Pham, Ana J. Chucair-Elliott, Augusto Schneider, Willard M. Freeman³, Michael B. Stout³

¹Aging and Metabolism Research Program,Oklahoma Medical Research Foundation, ²Genes & Human Disease Research Program,Oklahoma Medical Research Foundation, ³Oklahoma City Veterans Affairs Medical Center, ⁴Nutrition College,Federal University of Pelotas

Chapters

00:04Introduction
01:16Creation of the Nuclei Suspension
04:03Isolation of Nuclei Tagged in Specific Cell Types (INTACT)
06:02Performing Translating Ribosome Affinity Purification (TRAP)
10:02Results: Validation of Cyp17-NuTRAP Mouse Model
11:26Conclusion

Summary

Automatic Translation

En este protocolo, el método de purificación de afinidad ribosómica por traducción (TRAP) y el método de aislamiento de núcleos marcados en tipos celulares específicos (INTACT) se optimizaron para la interrogación pareada del transcriptoma ovárico específico de células y el epigenoma utilizando el modelo de ratón NuTRAP cruzado a una línea de ratón Cyp17a1-Cre.

Tags

Cell-specific Ovarian Epigenome Ovarian Transcriptome Cell Isolation Cell Type-specific Cre Driver Nuclei Isolation Cell Sorting Paired Analysis Ovarian Aging Female Infertility

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