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Artículo de método

El quitosano / ARN de interferencia mediada por nanopartículas silenciamiento génico en la enfermedad vectorial larvas de mosquitos

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DOI:

10.3791/52523

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25 de marzo de 2015

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* These authors contributed equally

En este artículo

Resumen

Aquí se describe un procedimiento para inhibir la función génica en los mosquitos vectores de enfermedades mediante el uso de quitosano / interferir nanopartículas de ARN que son ingeridas por las larvas.

Resumen

Mosquitos vectores infligen más sufrimiento humano que cualquier otro organismo - y matan a más de un millón de personas cada año. Los proyectos del genoma del mosquito facilitaron la investigación en nuevas facetas de la biología de los mosquitos, incluidos estudios genéticos funcionales en el principal vector de la malaria Anopheles gambiae africana y el dengue y la fiebre amarilla vector Aedes aegypti. ARN de interferencias (RNAi-) mediada por el silenciamiento de genes se ha utilizado para dirigir genes de interés en ambas de estas especies de mosquitos vectores de enfermedades. Aquí se describe un procedimiento para la preparación de quitosano / interferir nanopartículas de ARN que se combinan con los alimentos y ingeridos por las larvas. Este técnicamente sencilla, de alto rendimiento, y la metodología relativamente barato, que es compatible con una larga ARN de doble cadena (dsRNA) o pequeños ARN de interferencia (siRNA) moléculas, se ha utilizado para la caída con éxito de un número de diferentes genes en A. gambiae y A. aegyptilarvas. Siguiendo la alimentación de larvas, desmontables, que se verifica a través de QRT-PCR o hibridación in situ, pueden persistir por lo menos a través de la fase de pupa tarde. Esta metodología puede ser aplicable a una amplia variedad de mosquitos y otras especies de insectos, incluyendo las plagas agrícolas, así como otros organismos no modelo. Además de su utilidad en el laboratorio de investigación, en el futuro, quitosano, un polímero barato, no tóxico y biodegradable, podría potencialmente ser utilizada en el campo.

Introducción

Los mosquitos se alimentan de sangre de vectores de los géneros anofelinos y Aedine transmiten agentes patógenos responsables de varios de los peores flagelos de la humanidad. Se estima que unos 3,4 mil millones de personas están en riesgo de contraer la malaria, que es responsable de más de medio millón de muertes al año en todo el mundo. Resultados de la malaria de la infección por Plasmodium sp. Parásitos, que se transmiten al ser humano por la picadura de mosquitos infectados del género Anopheles, incluyendo el vector africano director Anopheles gambiae ( http://www.who.int/topics/malaria/....

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Protocolo

1. Mosquito Especies y Crianza

  1. Mantener A. gambiae G3 y A. cepas aegypti Liverpool IB12 (utilizados en los estudios representativos abajo) u otras cepas de interés de acuerdo con la práctica de laboratorio estándar o como se describe previamente 23,24.

2. dsRNA y siRNA Diseño y Producción

  1. Diseño cebadores para construir plantillas de ARN de doble cadena largos específicos para el gen de interés. Utilice la herramienta de E-RNAi 25. Producir dsRNA de acuerdo con el método de elección o como se describió previamente 19.
    1. Para un control negativo,....

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Resultados

A. gambiae:

Nanopartículas de quitosano / dsRNA se forman debido a la interacción electrostática entre los grupos amino de quitosano y los grupos fosfato de dsRNA. La eficiencia de la incorporación de dsRNA en nanopartículas es usualmente por encima de 90%, medido por el agotamiento de dsRNA de la solución. Imágenes de microscopía de fuerza atómica muestran que el quitosano-dsRNA promedios de tamaño de partícula 140 nm de diámetro, que van desde 100 hasta 200 .......

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Discusión

El / interferir metodología de nanopartículas de quitosano ARN descrito en este documento se ha utilizado para dirigir eficazmente genes durante el desarrollo larval en A. gambiae (Figuras 2, 3) y A. aegypti (Figuras 4, 5, 6, los cuadros 1, 2). Nanopartículas de quitosano pueden ser preparadas con cualquiera de largo dsRNA o siRNA, ambos de los cuales se han utilizado con éxito en los mosquitos como se evidencia por los resultados representativos descritos en el presen.......

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Divulgaciones

Los autores no tienen nada que revelar.

Agradecimientos

La financiación de la Estación Experimental Agrícola de Kansas y el Centro de Genómica de Artrópodos del Estado K para KYZ apoyó el desarrollo original del silenciamiento génico mediado por quitosano/dsRNA en A. gambiae19. El trabajo de A. gambiae descrito aquí fue apoyado en parte por R01-AI095842 de NIH/NIAID a KM. El desarrollo del silenciamiento génico mediado por quitosano/siRNA en A. aegypti20,21 fue apoyado por el premio R01-AI081795 de los NIH/NIAID a MDS. El contenido de este estudio es responsabilidad exclusiva de los autores y no representa necesariamente las opiniones oficiales de los NIH.

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Materiales

Lista de materiales utilizados en este artículo
NombreEmpresaNúmero de catálogoComentarios
0,02 ml pipemanRaininPR20para la resuspensión de ARN interferente
0,2 ml pipemanRaininPR200para la resuspensión de ARN interferente y preparación de ARN/nanopartículas interferentes
0,5 ml tubo graduado Fischer Scientific05-408-120para la alícuota de ARN interferente resuspendido
1 ml pipetaRaininPR1000para la resuspensión de ARN interferente y preparación de ARN interferente/nanopartículas
1,5 ml tubo graduado Fischer Scientific05-408-046para la preparación de ARN/nanopartículas interferentes
Acetato de sodio 1M, pH 4,5TEKnovaS0299para preparar tampón de acetato de sodio
Ácido acético, AIRSTAR. ACS, USP, FCC GradoBDHVWR BDH3092-500MLPpara preparar tampón de acetato de sodio
Agarosa Grado de Tecnología Genética MPBiomedicals LLC.800668ARN/nanopartículas interferentes preparadas
Eppendorf AG5415Dpara pellets de ARN/nanopartículas de interferencia
quitosano, de conchas de camarónSigma-AldrichC3646-25Gpara combinar con ARN interferente para la preparación de ARN/nanopartículas interferentes
Levadura secaUniversal Food CorpNApara preparar alimento para larvas de mosquitos con ARN interferente/ nanopartículas
Herramienta E-RNAiCentro Alemán de Investigación del CáncerNApara el diseño de dsRNA; http://www.dkfz.de/signaling/e-rnai3// alimento para
peces doradosWardleyGoldfish FLAKE FOODpara preparar alimento para larvas de mosquitos con ARN/nanopartículas que interfieren
Baño de agua calentadoThermo Scientific51221048para calentar el ARN/nanopartículas interferentes a 55oC
Hielono aplicableaplicablepara la descongelación de ARN interferente y la preparación de ARN/nanopartículas
[header]
Cubo de hieloFisher Scientific02-591-44para el almacenamiento de hielo utilizado durante el procedimiento,
polvo de hígadoMP Biomedicals LLC.900396para alimentar a las larvas de mosquitos después de la interferencia con el tratamiento de ARN/nanopartículas
Hornode microondas Una variedad de proveedoresno aplicablepara preparar solución de agarosa al 2%
Petrid (100 x 15 mm)Fischer Scientific875713la cámara de alimentación de ARN/nanopartículas interferentes para larvas
Medidor de pHMettler ToledoS220para la preparación de tampones
Cuchilla de afeitarFischer Scientific12-640para dividir el ARN interferente/pellet de nanopartículas para la alimentación
siRNAThermo Scientific/Dharmaconpersonalizadopara la preparación de siRNA/nanopartículas
Sulfato de sodio, anhidro (Na2SO4)BDH/distribuido por VWRVWR BDH0302-500Gpara preparar una solución de sulfato de sodio de 50 mM en la que se
Termómetroresuspendido VWR61066-046para medir la temperatura del baño
agua Palillos-dientesVWR470146-908para agitar durante la preparación de alimentos de ARN/nanopartículas de interferencia y el corte de gel de pellets
Congelador ultrabajovariedad de proveedoresno aplicablepara el almacenamiento de alícuotas de ARN interferente y ARN/nanopartículas interferentes a -80oC
Mezclador de vórticeFischer Scientific02-216-108para la preparación de quitosano/ARN interferente
Papel de pesoFischer Scientific NC9798735para dividir la pelletización de ARN/nanopartículas interferentes para la alimentación
para recubrir la centrífuga de no interferentes de Una

Referencias

  1. Malaria. , World Health Organization. http://www.who.int/topics/malaria/en (2014).
  2. Dengue. , Malaria Centers for Disease Control and Prevention. http://www.cdc.gov/dengue/ (2014).
  3. Knipling, E. F., et al. Genetic control of insects of public health importance. Bulletin of the World Health Organizat....

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