Le cytosquelette des microtubules forme le cadre d’une cellule et est fondamental pour le transport intracellulaire, la division cellulaire et la transduction du signal. La perturbation pharmacologique traditionnelle du réseau de microtubules omniprésents en utilisant, par exemple, le nocodazole peut avoir des conséquences dévastatrices pour n’importe quelle cellule. Les inhibiteurs de microtubules photocommutables de manière réversible ont le potentiel de surmonter les limites en permettant aux effets des médicaments d’être mis en œuvre de manière spatio-temporelle contrôlée. L’une de ces familles de médicaments est la photostatine à base d’azobenzène (PST). Ces composés sont inactifs dans des conditions sombres et, lors de l’éclairage par la lumière UV, ils se lient au site de liaison à la colchicine de la β-tubuline et bloquent la polymérisation des microtubules et le renouvellement dynamique. Ici, l’application de PST dans l’embryon de souris préimplantatoire vivant en 3 dimensions (3D) vise à perturber le réseau de microtubules au niveau subcellulaire. Ce protocole fournit des instructions pour la configuration expérimentale, ainsi que des paramètres d’activation et de désactivation de la lumière pour les PST utilisant la microscopie confocale à cellules vivantes. Cela garantit la reproductibilité et permet à d’autres d’appliquer cette procédure à leurs questions de recherche. Des photocommutateurs innovants comme les PST peuvent évoluer en tant qu’outils puissants pour faire progresser la compréhension du réseau dynamique de microtubules intracellulaires et pour manipuler le cytosquelette de manière non invasive en temps réel. En outre, les PST peuvent s’avérer utiles dans d’autres structures 3D telles que les organoïdes, les blastoïdes ou les embryons d’autres espèces.