Encyclopedia of Experiments: Biology
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-在 C. elegans 中,RNAi 可以通过喂养蠕虫细菌来诱导,这些细菌从重组的DNA质粒中表达双链RNA 或 dsRNA。
首先,在含有四环素和氨基青霉素的选择性LB agar板上生长四环素耐药性HT115大肠杆菌,或其功能模拟苯丙林。 除了目标DNA,质粒还含有抗氨基林的基因。 只有继承质粒的细菌菌落才能在这些抗生素的存在下生长。
接下来,收获细菌菌落,并将它们以液体LB介质扩展到所需的浓度。为了诱导dsRNA表达,将细菌溶液转移到准备好的线虫生长介质(NGM)上,即含有IPTG的阿加板块。
在这个表达系统中,IPTG模仿乳糖来激活乳糖抑制剂,从而产生T7RNA聚合酶的表达。在质粒上,目标DNA表达由两个收敛的T7促进者调节。因此,感官和抗感序列被转录,导致dsRNA的表达。
最后,蠕虫使用从摄入的dsRNA到具有互补序列的内源性mRNA的序列信息。在这个实验中,我们将用转基因大肠杆菌准备RNAi板,供C.elegans喂养。
- 对于 RNAi 板,用含有IPTG和卡苯丙林的NGM agar 装载6 厘米板。在黑暗中的室温下,让它们干燥 24 到 48 小时。然后,将它们转移到 4 摄氏度,长达 14 天。
接下来,含有苯甲酸素和四环素的条纹选择性板与RNAi细菌克隆与L4440质粒携带林-53基因。 使用三相条纹模式,并确保板一个空向量控制。 然后,在37摄氏度的温度下连夜生长板。
第二天,挑选至少三个单一的菌落,并给每个殖民地接种一个单独的文化管,用2毫升的LB补充卡本西林,但不是四环素。计划每个条件有三种健康的培养物。
其次,在37摄氏度的温度下一夜之间培养,直到它们达到0.6到0.8的600纳米的光学密度。然后,在6厘米的NGM agar RNAi板中加入每个细菌培养物的500微升。在黑暗中的室温下连夜孵化板。