Vi beskriver en metod för att upprepade gånger visualisera murina mikroglia och cirkulerande monocyter<em> In vivo</em> Över timmar, dagar eller veckor med transkraniell två-photon mikroskopi. Vi visar hur du förbereder en tunnas-skalle fönster som gör återkommande observationer av vilande mikroglia som kan aktiveras genom att intilliggande stereotaktisk injektion av HIV-1 reglerande proteinet Tat.