A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Chapters
- 00:05Title
- 01:40Constructing Non-essential Query Deletion in an Hfr Cavalli Donor Strain
- 06:42Arraying E. coli F-Recipient Mutants for E. coli Synthetic Genetic Array (eSGA) Screens
- 08:45High-density Strain Mating Procedure to Generate E. coli Double Mutants
- 11:01Results: Representative Analyses of Genetic Interaction (GI) Scores for Determining Pathway-level Functional Relationships
- 13:16Conclusion
Систематические крупномасштабные синтетические генетические (ген-ген или эпистаза) экранов взаимодействия может быть использована для изучения генетической избыточности и пути перекрестных помех. Здесь мы описываем высокой пропускной количественные синтетических генетических технологий скрининга массив, называемый eSGA, которые мы разработали для выяснения отношений эпистатических и изучение генных сетей взаимодействия в<em> Кишечной палочки</em>.
Tags
Bacterial Functional NetworksPathwaysEscherichia ColiSynthetic Genetic ArraysPhenotypesPhysical InteractionsFunctional InteractionsGene-gene InteractionsGenetic InteractionsGI ScreensEpistatic DependenciesFunctional RelationshipsLarge-scale GI MapsProkaryotesFunctional AnnotationBacterial GenomesQuantitative Bacterial GI Screening MethodsE. Coli Synthetic Genetic Array (eSGA) Screening ProcedureGenome-scale Screening
