A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Chapters
- 00:05Title
- 01:40Constructing Non-essential Query Deletion in an Hfr Cavalli Donor Strain
- 06:42Arraying E. coli F-Recipient Mutants for E. coli Synthetic Genetic Array (eSGA) Screens
- 08:45High-density Strain Mating Procedure to Generate E. coli Double Mutants
- 11:01Results: Representative Analyses of Genetic Interaction (GI) Scores for Determining Pathway-level Functional Relationships
- 13:16Conclusion
Systematiskt, storskaliga syntetiska genetiska (gen-gen eller epistasis) interaktion skärmar kan användas för att utforska genetiska redundans och väg överhörning. Här beskriver vi en hög genomströmning kvantitativ syntetisk genteknik array screening kallas eSGA som vi utvecklat för att belysa epistatisk relationer och utforska genetiska interaktion nätverk<em> Escherichia coli</em>.
Tags
Bacterial Functional NetworksPathwaysEscherichia ColiSynthetic Genetic ArraysPhenotypesPhysical InteractionsFunctional InteractionsGene-gene InteractionsGenetic InteractionsGI ScreensEpistatic DependenciesFunctional RelationshipsLarge-scale GI MapsProkaryotesFunctional AnnotationBacterial GenomesQuantitative Bacterial GI Screening MethodsE. Coli Synthetic Genetic Array (eSGA) Screening ProcedureGenome-scale Screening
