A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Chapters
- 00:05Title
- 00:59Cross-linking Chromatin
- 02:27Sonication
- 04:14Pre-clearing Chromatin
- 05:15Chromatin Immunoprecipitation
- 07:10Reversing Cross-link and Purifying DNA
- 08:12Results: Generation of a High Quality ChIP Template
- 09:28Conclusion
Kombinasjonen av kromatin immunoprecipitation og ultra-high-throughput sekvensering (ChIP-seq) kan identifisere og kartlegge protein-DNA vekselvirkninger i et gitt vev eller cellelinje. Skissert er hvordan å generere en høy kvalitet ChIP mal for etterfølgende sekvensering, ved hjelp av erfaring med transkripsjonsfaktor TCF7L2 som et eksempel.
