Multimodalitet imaging är en värdefull metod för att studera bakteriell kolonisation i små djurmodeller. Detta protokoll beskriver infektion hos möss med självlysande<em> Citrobacter rodentium</em> Och den längsgående övervakning av bakteriell kolonisering med komposit 3D diffus tomografi ljus avbildning med μCT bildbehandling för att skapa en 4D film av<em> C. rodentium</em> Infektion.