RNA polymerase II syntetiserer en forløper RNA som strekker seg utover den 3'-enden av det modne mRNA. Den enden av det modne RNA genereres cotranscriptionally, på et sted diktert av RNA-sekvenser, via endonuklease aktivitet av spalting kompleks. Her har vi detaljer metoden for å studere cleavage reaksjoner in vitro.