Vi beskriver en teknikk for analyse av global RNA syntese i hypoksi ved hjelp av bildebehandling. Klikk-kjemi merking av RNA har ikke tidligere blitt utført under hypoksi og tillater visualisering av globale RNA endringer på celle-nivå. Denne tilnærmingen utfyller de eksisterende gjennomsnitt RNA teknikker, som tillater direkte visualisering av celle-til-celle endringer i global RNA-syntese.