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DNA-affinity-purified Chip (DAP-chip) Method to Determine Gene Targets for Bacterial Two component Regulatory Systems
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Purificado de ADN afinidad Chip (DAP-chip) Método para determinar los objetivos de genes para bacteriana Dos Sistemas Regulatorios componentes

DOI:
10.3791/51715-v

•

12:24 min

•

July 21, 2014

•

, ,
1Physical Biosciences Division,Lawrence Berkeley National Laboratory

Chapters

  • 00:05Title
  • 01:57Determine Gene Target for Response Regulator Using Electrophoretic Mobility Shift Assay
  • 03:54Verify Target Enrichment after Genomic DNA-protein Binding
  • 07:19DNA Labeling and Array Hybridization
  • 10:11Results: DAP-chip Analysis of Gene Targets and Binding Sites for Response Regulators
  • 11:51Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Este artículo de vídeo describe un método de microarrays basado en vitro para determinar los objetivos de genes y sitios de unión para dos reguladores de respuesta del sistema de componentes.

Tags

Keywords: DNA-affinity-purified ChipDAP-chipBacterial Two Component Regulatory SystemsGene TargetsTranscription FactorsChIP-chipResponse RegulatorsIn Vitro MicroarrayAffinity PurificationTiling ArrayBinding Site MotifsDesulfovibrio Vulgaris HildenboroughSigma54-dependent Response Regulator

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