Generation of Native Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Libraries for Nucleosome Density Analysis

Alireza Lorzadeh; Rodrigo Lopez Gutierrez; Linda Jackson; Michelle Moksa; Martin Hirst

doi:10.3791/56085

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Generazione di immunoprecipitazione della cromatina nativo sequenziamento librerie per analisi di densità del nucleosoma

Generation of Native Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Libraries for Nucleosome Density Analysis

JoVE Journal
Genetics

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JoVE Journal Genetics

Generation of Native Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Libraries for Nucleosome Density Analysis

Generazione di immunoprecipitazione della cromatina nativo sequenziamento librerie per analisi di densità del nucleosoma

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10:05 min

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December 12, 2017

DOI:

10.3791/56085-v

DOI:

10.3791/56085-v

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10:05 min

December 12, 2017

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Alireza Lorzadeh¹, Rodrigo Lopez Gutierrez¹, Linda Jackson¹, Michelle Moksa¹, Martin Hirst^1,2

¹Department of Microbiology and Immunology, Michael Smith Laboratories Centre for High-Throughput Biology,University of British Columbia, ²Canada’s Michael Smith Genome Science Center,BC Cancer Agency

Transcript

Summary

Vi presentiamo un'immunoprecipitazione della cromatina native modificate sequenziamento (ChIP-seq) metodologia per la generazione di sequenza DataSet adatto per un quadro analitico di densità ChIP-seq nucleosoma integrando l'accessibilità nucleasi di micrococcal (MNase) con misure di modifica dell'istone.