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ネイティブのクロマチン免疫沈降のヌクレオソーム密度解析ライブラリをシーケンスの生成

JoVE Journal
Genetics

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JoVE Journal Genetics

Generation of Native Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Libraries for Nucleosome Density Analysis

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ネイティブのクロマチン免疫沈降のヌクレオソーム密度解析ライブラリをシーケンスの生成

DOI:

10.3791/56085-v

•

10:05 min

•

December 12, 2017

•

Alireza Lorzadeh, Rodrigo Lopez Gutierrez, Linda Jackson, Michelle Moksa, Martin Hirst²

¹Department of Microbiology and Immunology, Michael Smith Laboratories Centre for High-Throughput Biology,University of British Columbia, ²Canada’s Michael Smith Genome Science Center,BC Cancer Agency

Chapters

00:05Title
00:51Cell Lysis and Chromatin Digestion for Nucleosome Density ChIP-se
03:21Immunprecipitation Reaction for Nucleosome Density ChIP-seq
04:33Washes and Elution for Nucleosome Density ChIP-seq
07:31Results: Evaluation of Nucleosome Density ChIP-seq Libraries
08:50Conclusion

Summary

Automatic Translation

提案するミクロコッカスヌクレアーゼ (MNase) のアクセシビリティを統合ヌクレオソーム密度チップ seq 解析フレームワークに適したシーケンスデータセットの生成 (チップ seq) 方法論をシーケンス変更されたネイティブクロマチン免疫沈降ヒストン修正測定。

Tags

Keywords: Native Chromatin Immunoprecipitation Nucleosome Density Analysis Epigenetics Epigenomic Features Chromatin Signatures MNase Cell Preparation Lysis Buffer MNase Digestion EDTA

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