Journal
/
Genetics
/
Generation av infödda kromatin Immunoprecipitation sekvensering bibliotek för Nucleosome densitet analys
JoVE Journal
Genetics
This content is Free Access.
JoVE Journal Genetics
Generation of Native Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Libraries for Nucleosome Density Analysis
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Generation av infödda kromatin Immunoprecipitation sekvensering bibliotek för Nucleosome densitet analys

DOI:
10.3791/56085-v

•

10:05 min

•

December 12, 2017

•

, , , ,
1Department of Microbiology and Immunology, Michael Smith Laboratories Centre for High-Throughput Biology,University of British Columbia, 2Canada’s Michael Smith Genome Science Center,BC Cancer Agency

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:51Cell Lysis and Chromatin Digestion for Nucleosome Density ChIP-se
  • 03:21Immunprecipitation Reaction for Nucleosome Density ChIP-seq
  • 04:33Washes and Elution for Nucleosome Density ChIP-seq
  • 07:31Results: Evaluation of Nucleosome Density ChIP-seq Libraries
  • 08:50Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Vi presenterar en modifierad infödda kromatin immunoprecipitation sekvensering (ChIP-seq) metodik för generering av sekvens datamängder lämpar sig för en nukleosomens densitet ChIP-seq analytisk ram att integrera micrococcal nuclease (MNase) hjälpmedel med Histon modifiering mätningar.

Tags

Native Chromatin ImmunoprecipitationNucleosome Density AnalysisEpigeneticsEpigenomic FeaturesChromatin SignaturesMNaseCell PreparationLysis BufferMNase DigestionEDTA

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Optimering och jämförande analys av organellära DNA-berikningsmetoder lämpliga för nästa generations sekvensering

Analys av c-KIT-ligand-promotorn med användning av kromatinimmunfällning

Kromatinimmunutfällning (ChIP) i mus-T-celllinjer

Kromatin Immunoprecipitation (ChIP) protokoll för låg-överflöd embryonala prover

Generation av Genome-wide kromatin konformation fånga bibliotek från tätt stegvis tidiga Drosophila embryon

Kromatin Immunoprecipitation (ChIP) Histon ändringar från Saccharomyces cerevisiae

Kromatin Immunoprecipitation av murina Brun fettvävnad

Kromatin immunoprecipitation analys med hjälp av Micrococcal nukleaser i däggdjursceller

Upptäcka CsgD regulatoriska mål i salmonella biofilm med kromatin immunoprecipitation och högt dataflöde sekvensering (chip-SEQ)

Optimering för sekvensering och analys av försämrade FFPE-RNA-prover

Read Article