Denne protokollen beskriver en eksperimentelle prosedyren kvantitativt og omfattende undersøke metabolismen av flere næringsstoffer kilder. Denne arbeidsflyten, basert på en kombinasjon av isotopanrikning tracer eksperimenter og en analytiske prosedyren kan skjebnen til brukte næringsstoffer og metabolske opprinnelsen til molekyler synthetized av mikroorganismer skal fastsettes.