This content is Free Access.
1Nuclear Dynamics Programme, The Babraham Institute,Babraham Research Campus, 2IJC Building, Campus ICO-Germans Trias i Pujol,Josep Carreras Leukemia Research Institute, 3Departamento de Genética Molecular, Instituto de Fisiología Celular,Universidad Nacional Autónoma de México, 4Bioinformatics Group, The Babraham Institute,Babraham Research Campus, 5Department of Biological Science,Florida State University
Chapters
- 00:04Title
- 00:52Formaldehyde Fixation
- 02:14HindIII Digestion and Biotinylation of Restriction Fragment Overhangs
- 04:09Hybrid In-solution Capture
- 06:53Isolation of Promoter Fragment-containing Ligation Products
- 08:55Results: IL8 PCHi-C Profile in Human Hematopoietic Cells
- 09:34Conclusion
DNA regelgevende elementen, zoals versterkers, kwaliteitsbeheersing genexpressie door fysiek contact met target gene initiatiefnemers, vaak door middel van lange-afstands chromosomale interacties verspreid over grote genomic afstanden. Promotor vangen Hi-C (PCHi-C) identificeert belangrijke interacties tussen initiatiefnemers en distale regio's, waardoor de toewijzing van potentiële regulerende sequenties aan hun doelgenen.
