Journal
/
/
Promotoren fange Hei-C: Med høy oppløsning, genomet-bred profilering av arrangøren interaksjoner
JoVE Journal
Genetics
This content is Free Access.
JoVE Journal Genetics
Promoter Capture Hi-C: High-resolution, Genome-wide Profiling of Promoter Interactions
DOI:

10:16 min

June 28, 2018

, , , ,

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:52Formaldehyde Fixation
  • 02:14HindIII Digestion and Biotinylation of Restriction Fragment Overhangs
  • 04:09Hybrid In-solution Capture
  • 06:53Isolation of Promoter Fragment-containing Ligation Products
  • 08:55Results: IL8 PCHi-C Profile in Human Hematopoietic Cells
  • 09:34Conclusion

Summary

Automatic Translation

DNA regulatoriske elementer, for eksempel enhancers, kontrollere genuttrykk ved fysisk å kontakte målet genet arrangører, ofte gjennom langtrekkende chromosomal interaksjoner spenner genomisk distanser. Promotoren fange Hi-C (PCHi-C) identifiserer betydelig interaksjon mellom arrangører og distale regioner, aktivere tilordningen av potensielle regulatoriske sekvenser til sine mål gener.

Related Videos

Read Article