Journal
/
Genetics
/
MicroARN rétrospective séquençage : L’ADN complémentaire bibliothèque protocole de préparation à l’aide de spécimens d’ARN de paraffine fixés au formol
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Retrospective MicroRNA Sequencing: Complementary DNA Library Preparation Protocol Using Formalin-fixed Paraffin-embedded RNA Specimens
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

MicroARN rétrospective séquençage : L’ADN complémentaire bibliothèque protocole de préparation à l’aide de spécimens d’ARN de paraffine fixés au formol

DOI:
10.3791/57471-v

•

12:24 min

•

May 05, 2018

•

, , ,
1Department of Research,Hackensack University Medical Center, 2Department of Medical Sciences,Seton Hall University, 3Department of Epidemiology and Population Health,Albert Einstein College of Medicine, 4Department of Nephrology and Hypertension,Hadassah – Hebrew University Medical Center

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:393′ Barcoded Adapter Ligations with 18 Individual RNA Samples
  • 02:00Ligated Small RNA Purification
  • 05:265′ Ligated and 3′ Barcoded Purified Small RNAs Reverse Transcription
  • 08:12Pilot PCR and Large-scale PCR Amplification
  • 10:46Results: Protocol Robust Whether Fresh, Frozen, or Aged
  • 12:01Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Fixés au formol des spécimens de paraffine représentent une source précieuse de biomarqueurs moléculaires des maladies humaines. Nous présentons ici un protocole de préparation du bibliothèque de cDNA en laboratoire, initialement conçu avec de l’ARN congelée fraîche et optimisé pour l’analyse des microARN archivés des tissus conservés jusqu'à 35 ans.

Tags

MicroRNASequencingCDNA LibraryFormalin-fixed Paraffin-embeddedRNAProtocolLigationAdapterPrecipitationCentrifugation

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Méthyl-liaison par capture d'ADN de séquençage pour les tissus du patient

Cartographie des interactions ARN-ARN à l'échelle mondiale à l'aide de psoralène biotinylé

Évaluation de la Contamination d’ADN dans les échantillons d’ARN issu de l’ADN ribosomique

Un protocole universel pour à grande échelle gRNA bibliothèque Production provenant de toute Source d’ADN

Isolement d’ADN robuste et Construction de bibliothèque de séquençage haut-débit pour les spécimens d’herbier

Détection des événements rares en utilisant l’erreur corrigée ADN et le séquençage de l’ARN

Ultra basse génome d’entrée séquençage bibliothèque préparation à partir d’un seul spécimen Tardigrade

Séquençage de l’ARNm de sang total à l’aide du séquençage NANOPORE

Séquençage et analyse de l'ARN unicellulaire des îlots pancréatiques humains

Identification des empreintes de pas de l'ARN: Complexes protéiques par l'intermédiaire de l'immunoprécipitation d'ARN dans Tandem suivi du séquençage (RIPiT-Seq)

Read Article