Journal
/
Developmental Biology
/
CARIP-Seq и чип Seq: методы для идентификации связанных Chromatin РНК и ДНК белковых взаимодействий в эмбриональных стволовых клеток
JoVE Journal
Developmental Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Developmental Biology
CARIP-Seq and ChIP-Seq: Methods to Identify Chromatin-Associated RNAs and Protein-DNA Interactions in Embryonic Stem Cells
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

CARIP-Seq и чип Seq: методы для идентификации связанных Chromatin РНК и ДНК белковых взаимодействий в эмбриональных стволовых клеток

DOI:
10.3791/57481-v

•

11:13 min

•

May 25, 2018

•

1Department of Oncology,Wayne State University School of Medicine, 2Karmanos Cancer Institute,Wayne State University School of Medicine

Chapters

  • 00:04Title
  • 01:02Crosslinking of Embryonic Stem Cells for ChIP and CARIP
  • 02:29Chromatin Sonication for ChIP and CARIP
  • 03:48ChIP and CARIP Process
  • 07:12Double-stranded cDNA Synthesis for CARIP-Seq
  • 08:53Use of ChIP-Seq and CARIP-Seq to Study Global Protein-DNA Interactions and Chromatin-Associated RNAs in Embryonic Stem Cells
  • 10:43Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Здесь мы описываем методы для выполнения чип-Seq и CARIP-Seq, включая подготовку библиотека для виртуализации нового поколения, для создания глобального epigenomic и связанные хроматина РНК карт в ES клеток.

Tags

CARIP-SeqChIP-SeqChromatin-associated RNAsProtein-DNA InteractionsEmbryonic Stem CellsEpigeneticsTranscription FactorsEpigenetic RegulatorsHistone ModificationsChromatin ImmunoprecipitationSonicationFormaldehyde Cross-linkingGlycinePhosphate Buffered SalineTrypsinizationMEF MediumFetal Bovine SerumSonication BufferSodium Dodecyl Sulfate

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Генома Снимок хроматина регуляторов и государства в<em> Xenopus</em> Эмбрионы по чип-Seq

Дифференциация нейронных эмбриональных стволовых клеток мыши в бессывороточной монослоя культуры

Создание CRISPR / cas9 опосредованного моноаллельной Пропуски для изучения Enhancer Функция в эмбриональных стволовых клетках мышей

Эпигенетическое регуляции сердечной дифференциации эмбриональных стволовых клеток и тканей

Выделение мышиной эмбриональных кроветворных эндотелиальных клеток

Простой метод для идентификации киназ, которые регулируют плюрипотентность эмбриональных стволовых клеток посредством высокопроизводительного скрининга ингибиторов

Горизонтальная целая гора: новый протокол обработки и обработки изображений для толстых, трехмерных поперечных сечений кожи

Быстрое, режиссер дифференциация клеток эпителия сетчатки пигмента от человеческого эмбриона или индуцированных плюрипотентных стволовых клеток

Photoconversion одноклеточных в живых нетронутыми данио рерио

Вычислительный анализ микрофлорой Caenorhabditis elegans для изучения распределения ядер, белки и Цитоскелет

Read Article