Her, beskriver vi en protokol til at visualisere motorneuron projektion og axon arborization i transgene Hb9::GFP mus embryoner. Efter immunfarvning for motoriske neuroner brugte vi lys ark Fluorescens mikroskopi billede embryoner til efterfølgende kvantitativ analyse. Denne protokol finder anvendelse på andre neuron navigation processer i centralnervesystemet.