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एक एकल Tardigrade नमूना से Ultralow इनपुट जीनोम अनुक्रमण पुस्तकालय तैयारी

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Genetics
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Ultralow Input Genome Sequencing Library Preparation from a Single Tardigrade Specimen

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एक एकल Tardigrade नमूना से Ultralow इनपुट जीनोम अनुक्रमण पुस्तकालय तैयारी

DOI:

10.3791/57615-v

•

10:28 min

•

July 15, 2018

•

Yuki Yoshida², Sayuri Konno³, Ryousuke Nishino³, Yumi Murai³, Masaru Tomita^2,3, Kazuharu Arakawa^2,3

¹Institute for Advanced Biosciences,Keio University, ²Systems Biology Program, Graduate School of Media and Governance,Keio University, ³Faculty of Environment and Information Studies,Keio University

Chapters

00:00Title
01:11Sample preparation and contaminant exclusion
02:10Homogenization and DNA extraction
04:41Sequencing library construction
05:48Purification of the PCR reaction
06:19DNA quality check and quantification, and sequencing
07:43Sequencing of the DNA library
08:02Representative results
09:35Closing remarks

Summary

Automatic Translation

सूक्ष्म जीवों के जीनोमिक अनुक्रमण के दौरान संदूषण एक बड़ी समस्या बनी हुई है । यहां, हम एक विधि दिखाने के लिए एक नमूना से एक tardigrade के जीनोम के रूप में छोटे के रूप में जीनोमिक डीएनए के पूरे जीनोम प्रवर्धन के साथ कम से कम के लिए संदूषण के जोखिम को ंयूनतम ।

Tags

Tardigrade Genome Sequencing Single Specimen Ultralow Input Genomic DNA Homogenization Freeze-thaw Pipette Crushing Library Preparation MiSeq Sequencing Bacterial Contamination Antibiotics Agarose Gel Microscopy Lysis Buffer DNA Extraction

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