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Ultra basse génome d’entrée séquençage bibliothèque préparation à partir d’un seul spécimen Tardigrade
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Ultralow Input Genome Sequencing Library Preparation from a Single Tardigrade Specimen
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Ultra basse génome d’entrée séquençage bibliothèque préparation à partir d’un seul spécimen Tardigrade

DOI:
10.3791/57615-v

•

10:28 min

•

July 15, 2018

•

, , , , ,
1Institute for Advanced Biosciences,Keio University, 2Systems Biology Program, Graduate School of Media and Governance,Keio University, 3Faculty of Environment and Information Studies,Keio University

Chapters

  • 00:00Title
  • 01:11Sample preparation and contaminant exclusion
  • 02:10Homogenization and DNA extraction
  • 04:41Sequencing library construction
  • 05:48Purification of the PCR reaction
  • 06:19DNA quality check and quantification, and sequencing
  • 07:43Sequencing of the DNA library
  • 08:02Representative results
  • 09:35Closing remarks

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Contamination pendant le séquençage génomique des organismes microscopiques demeure un grand problème. Ici, nous montrons une méthode pour séquencer le génome d’un tardigrade un seul spécimen avec aussi peu que 50 pg d’ADN génomique sans amplification du génome entier pour minimiser le risque de contamination.

Tags

TardigradeGenome SequencingSingle SpecimenUltralow InputGenomic DNAHomogenizationFreeze-thawPipette CrushingLibrary PreparationMiSeq SequencingBacterial ContaminationAntibioticsAgarose GelMicroscopyLysis BufferDNA Extraction

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