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Ultralow 입력된 게놈 시퀀싱 단일 Tardigrade 견본에서 라이브러리 준비

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Genetics
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JoVE Journal Genetics

Ultralow Input Genome Sequencing Library Preparation from a Single Tardigrade Specimen

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Ultralow 입력된 게놈 시퀀싱 단일 Tardigrade 견본에서 라이브러리 준비

DOI:

10.3791/57615-v

•

10:28 min

•

July 15, 2018

•

Yuki Yoshida², Sayuri Konno³, Ryousuke Nishino³, Yumi Murai³, Masaru Tomita^2,3, Kazuharu Arakawa^2,3

¹Institute for Advanced Biosciences,Keio University, ²Systems Biology Program, Graduate School of Media and Governance,Keio University, ³Faculty of Environment and Information Studies,Keio University

Chapters

00:00Title
01:11Sample preparation and contaminant exclusion
02:10Homogenization and DNA extraction
04:41Sequencing library construction
05:48Purification of the PCR reaction
06:19DNA quality check and quantification, and sequencing
07:43Sequencing of the DNA library
08:02Representative results
09:35Closing remarks

Summary

Automatic Translation

미세한 생물의 게놈 시퀀싱 하는 동안 오염에는 큰 문제가 남아 있다. 여기, 우리가 오염 위험을 최소화 하기 위해 전체 게놈 증폭 없이 genomic DNA의 작은 50 세와 단일 표본에서 tardigrade의 게놈을 시퀀싱 하는 방법을 보여줍니다.

Tags

Tardigrade Genome Sequencing Single Specimen Ultralow Input Genomic DNA Homogenization Freeze-thaw Pipette Crushing Library Preparation MiSeq Sequencing Bacterial Contamination Antibiotics Agarose Gel Microscopy Lysis Buffer DNA Extraction

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