Her præsenterer vi en protokol, der beskriver en strømlinet metode til effektiv generering af plasmider, der udtrykker både CRISPR-enzymet og tilhørende enkelt guide RNA (sgRNAs). Co-transfektion af pattedyrceller med denne sgRNA/ CRISPR vektor og en dobbelt luciferase reporter vektor, der undersøger dobbelt-streng pause reparation giver mulighed for evaluering af knockout effektivitet.