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超低入力キャリア-CAGEを使用した転写開始サイトマッピング
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Transcription Start Site Mapping Using Super-low Input Carrier-CAGE
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超低入力キャリア-CAGEを使用した転写開始サイトマッピング

DOI:
10.3791/59805-v

•

06:59 min

•

June 26, 2019

•

, ,
1Institute of Clinical Sciences, Faculty of Medicine,Imperial College London, 2MRC London Institute of Medical Sciences, 3Sars International Centre for Marine Molecular Biology,University of Bergen

Chapters

  • 00:04Title
  • 01:04Preparation of DNA Templates
  • 01:38Reverse Transcription
  • 02:24Purification of cDNA:RNA Hybrids Using Magnetic Beads
  • 03:42Cap-trapping
  • 05:16Control of Degradation Level and Determination of the Number of PCR Cycles
  • 05:39Results: DNA Quality and Validation of SLIC-CAGE Libraries
  • 06:26Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

遺伝子発現のキャップ解析(CAGE)は、単一ヌクレオチド分解能でRNAポリメラーゼII転写開始部位を捕捉するためにmRNA5'端部のゲノム全体の定量マッピングのための方法である。本研究では、総RNAのナノグラム量を用いて高品質なライブラリを生成するための低入力(SLIC-CAGE)プロトコルについて述べている。

Tags

Transcription Start Site MappingSLIC-CAGECarrier-CAGERNA Polymerase IIGene RegulationCore PromoterEnhancer DiscoveryDiagnostic MarkersEmbryonic DevelopmentReverse TranscriptionSPRI Magnetic Beads

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