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Cartographie du site de démarrage de la transcription à l'aide d'un transporteur-CAGE super-faible
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Transcription Start Site Mapping Using Super-low Input Carrier-CAGE
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Cartographie du site de démarrage de la transcription à l'aide d'un transporteur-CAGE super-faible

DOI:
10.3791/59805-v

•

06:59 min

•

June 26, 2019

•

, ,
1Institute of Clinical Sciences, Faculty of Medicine,Imperial College London, 2MRC London Institute of Medical Sciences, 3Sars International Centre for Marine Molecular Biology,University of Bergen

Chapters

  • 00:04Title
  • 01:04Preparation of DNA Templates
  • 01:38Reverse Transcription
  • 02:24Purification of cDNA:RNA Hybrids Using Magnetic Beads
  • 03:42Cap-trapping
  • 05:16Control of Degradation Level and Determination of the Number of PCR Cycles
  • 05:39Results: DNA Quality and Validation of SLIC-CAGE Libraries
  • 06:26Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Cap Analysis of Gene Expression (CAGE) est une méthode de cartographie quantitative à l'échelle du génome de l'ARNm 5'ends pour capturer les sites de transcription de la polymérase II de l'ARN à une résolution à un seul nucléotide. Ce travail décrit un protocole à faible apport (SLIC-CAGE) pour la génération de bibliothèques de haute qualité utilisant des quantités de nanogrammes d'ARN total.

Tags

Transcription Start Site MappingSLIC-CAGECarrier-CAGERNA Polymerase IIGene RegulationCore PromoterEnhancer DiscoveryDiagnostic MarkersEmbryonic DevelopmentReverse TranscriptionSPRI Magnetic Beads

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