Här presenterar vi ett robust protokoll för att kvantifiera 40 föreningar som är involverade i Central kol-och energimetabolism i cell fria proteinsyntes reaktioner. Den cell fria syntes blandningen är derivatiserad med anilin för effektiv separation med hjälp av omvänd fas vätskekromatografi och sedan kvantifieras med masspektrometri med isotopiskt märkta interna standarder.