यहाँ, हम सेल मुक्त प्रोटीन संश्लेषण प्रतिक्रियाओं में केंद्रीय कार्बन और ऊर्जा चयापचय में शामिल 40 यौगिकों की मात्रा निर्धारित करने के लिए एक मजबूत प्रोटोकॉल प्रस्तुत करते हैं। सेल मुक्त संश्लेषण मिश्रण उलट चरण तरल क्रोमैटोग्राफी का उपयोग कर प्रभावी जुदाई के लिए aniline के साथ derivatized है और फिर समस्थानिक आंतरिक मानकों का उपयोग कर बड़े पैमाने पर स्पेक्ट्रोमेट्री द्वारा परिमाणित.