Journal
/
Genetics
/
Kombinere Laser Capture Microdissection og Mikrofluidic qPCR å analysere transkripsjonsprofiler av enkeltceller: En systembiologi tilnærming til opioidavhengighet
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Combining Laser Capture Microdissection and Microfluidic qPCR to Analyze Transcriptional Profiles of Single Cells: A Systems Biology Approach to Opioid Dependence

Kombinere Laser Capture Microdissection og Mikrofluidic qPCR å analysere transkripsjonsprofiler av enkeltceller: En systembiologi tilnærming til opioidavhengighet

DOI:
10.3791/60612-v

•

09:54 min

•

March 08, 2020

•

, , , ,
1Daniel Baugh Institute for Functional Genomics and Computational Biology, Department of Pathology, Anatomy, and Cell Biology,Thomas Jefferson University, 2Sidney Kimmel Medical College,Thomas Jefferson University, 3Department of Pharmacology & Physiology,Drexel University College of Medicine

Chapters

  • 00:05Introduction
  • 00:59Preparing the Samples
  • 02:16Laser Capture Microdissection
  • 04:07Single-cell Microfluidic RT-qPCR
  • 08:08Results: Microfluidic qPCR Yields Accurate and Anatomically Specific Transcriptional Profiles of Single-Cells
  • 09:21Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Denne protokollen forklarer hvordan man samler enkeltnevroner, mikroglia og astrocytter fra amygdalas sentrale kjerne med høy nøyaktighet og anatomisk spesifisitet ved hjelp av laserfangstmikrodisseksjon. I tillegg forklarer vi vår bruk av mikrofluidic RT-qPCR for å måle et undersett av transkripsjonen av disse cellene.

Tags

Laser Capture MicrodissectionMicrofluidic QPCRTranscriptional ProfilesSingle CellsSystems BiologyOpioid DependenceGene ExpressionCellular SubphenotypesAnatomic SpecificityBiological ProblemsNeuronsBrain RegionsAmygdalaEthanol DehydrationXyleneFluorescenceLCM SoftwareInfrared Laser

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Encellede Gene Expression Bruke Multiplex RT-qPCR å karakter heterogenitet av sjeldne lymfoide populasjoner

Encellede Gene Expression Profilering hjelp FACS og qPCR med interne standarder

Enkelt Molecule Analyse av Laser Lokalisert psoralen addukter

Laser Microirradiation å studere i Vivo mobilnettet Svar å enkle og komplekse DNA skade

Tilpasning av hybridisering erobringen av Chromatin-assosiert proteiner for Proteomikk til pattedyrceller

Ultralow inngang genomet sekvensering biblioteket forberedelse fra en enkelt Tardigrade prøven

En roman metning mutagenese tilnærming: Enkeltsteg karakteristikk av regulatoriske Protein bindende områder i RNA bruker Phosphorothioates

Metoden sett replika: En høy gjennomstrømming tilnærming til kvantitativt mål Caenorhabditis elegans levetid

En kombinasjon encellede tilnærming som karakteriserer den molekylære og Immunophenotypic heterogenitet menneskelige stammen og stamfar bestander

Generering av kreft cellen kloner å visualisere Telomeric gjenta inneholder RNA TERRA uttrykt fra en enkelt Telomere i levende celler

Read Article