Journal
/
Biology
/
Transposon Insertion Libraries genereren in gram-negatieve bacteriën voor high-throughput sequencing
JoVE Journal
Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
Generating Transposon Insertion Libraries in Gram-Negative Bacteria for High-Throughput Sequencing
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Transposon Insertion Libraries genereren in gram-negatieve bacteriën voor high-throughput sequencing

DOI:
10.3791/61612-v

•

08:19 min

•

July 07, 2020

•

, ,
1Department of Biology,University of Texas at Arlington

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:57Bacterial Mating
  • 02:47Generation of Final Bacterial Mutant Library
  • 04:11DNA Shearing and Poly-C Tail Addition
  • 06:23Results: Transposon Mutant Library
  • 07:31Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

We beschrijven een methode om verzadigende transposon mutantbibliotheken te genereren in gramnegatieve bacteriën en de daaropvolgende voorbereiding van DNA-ampliconbibliotheken voor hoge doorvoersequenties. Als voorbeeld richten we ons op de ESKAPE-ziekteverwekker, Acinetobacter baumannii,maar dit protocol is vatbaar voor een breed scala aan gramnegatieve organismen.

Tags

Transposon Insertion LibraryGram-negative BacteriaHigh-throughput SequencingEssential GenesAntibiotic ResistanceIn Vivo FitnessMechanical ShearingPoly-CTLRestriction EnzymesAdapter LigationBacterial GeneticsGenotype-phenotype RelationshipsMatingDiaminopimelic AcidGlycerolFrozen Stock

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Een High Throughput Scherm voor Biomining cellulase activiteit van Metagenomic Bibliotheken

Concurrerende Genomische Schermen van streepjescode Gist Bibliotheken

High-throughput versuikering test voor Lignocellulose Materialen

Generatie van hoge kwaliteit Chromatine immunoprecipitatie DNA Template voor High-throughput sequencing (ChIP-seq)

Zeer efficiënte Ligatie van Kleine RNA-moleculen voor MicroRNA Kwantificering van High-throughput sequencing

Herstel van de Adult zebravis Harten voor High-throughput Toepassingen

High-throughput screening voor Chemische Modulators van Post-transcriptioneel gereguleerde genen

Een protocol voor Functionele Evaluatie van Whole-Protein verzadigingsmutagenese Bibliotheken Met behulp van High-throughput sequencing

High-throughput Screening op basis van eiwitten erfdeel in S. cerevisiae

Gewijzigde methoden voor het laden van DNA-extractieplaten met hoge doorvoer verminderen het potentieel voor verontreiniging

Read Article